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1、通風引流促干燥。
災后氣候高溫濕熱，要加大畜禽欄舍通風引流，及時清理或深挖欄舍周邊的排水溝，幼畜禽舍鋪設干燥的木墊板或用火爐烤干，將舍內水汽排出，使畜禽特別是幼畜禽遠離潮濕地面，預防小豬腹瀉病等。要注意防暑降溫，同時保持畜禽欄舍內衛生，定期殺蚊滅蠅及滅鼠，及時清理糞尿，保持畜禽欄舍內安靜，創造良好的飼養環境。降低欄舍內飼養密度，商品畜禽達到出欄標準的要盡快出欄;及時淘汰低齡、體弱、傷殘、病情嚴重的畜禽，降低飼養成本。
2、加緊養殖欄舍修復。
對因災損壞嚴重的欄舍，要抓緊修復。若原欄舍選址不當或難以抵抗自然災害的，需異地再建，宜選擇地勢較高、地質穩定、通風向陽、排水方便、遠離保護水源、干線公路、工廠、居民聚集的地方。欄舍再建或修復要特別注意畜舍的堅固性，防止欄舍倒塌造成畜禽死傷;要綜合考慮當前夏季高溫防暑工作，修建畜舍要采用隔熱材料，注意通風;兼顧冬季保暖設施建設，可設置易拆卸的擋風保暖材料，如草簾、塑料布簾或帆布簾等。
3、確保養殖投入品供給。
一是飼料安全。飼料致霉霉菌主要有黃曲霉、煙曲霉等，水災后飼料堆積或貯存過久霉菌會大量繁殖，導致飼料霉爛，霉變飼料不能直接飼喂畜禽，以防霉菌毒素中毒;對結塊或輕微霉變的飼料經脫毒處理后可少量搭配飼喂;飼料要注意干燥清潔，空氣流通，貯存飼料的庫房一定不要潮濕，堆放的飼料要離地面高些，如果飼料發霉的非常嚴重，不可用做飼料來喂豬，以防霉菌中毒;保存飼料使用現配現用，同時可添加克霉凈防霉，在每噸配合飼料中加入0.5 kg的克霉凈，可使飼料 2 個月不霉變結塊。災后要特別注意給畜禽增加精飼料喂量，少添勤喂，以防剩料過夜后發生霉變;合理搭配青、精、粗飼料，日糧組成盡量營養全面，提高飼料的營養成分，增加蛋白質含量;適當增喂一些復合多維，如維生素B、維生素C、維生素E和亞硒酸鈉、電解質、微生態制劑及免疫增強劑(如黃芪多糖)等，以增強機體的抗應激能力和抵抗力。如牛羊可多喂能量含量較高的玉米、麥(麩)等谷物飼料，飼喂優質青貯飼料，使膘情和體質盡快恢復，防止妊娠母畜流產。為清涼解暑，可在飼料中添加一些新鮮蔬菜、西瓜皮等，避免畜禽過量飲水導致體液代謝紊亂。
二是飲水安全。要供給充足、清潔、衛生的飲水。畜禽飲用水源消毒，使用地下水的豬場，應先用明礬等對其沉淀處理，再用消毒劑如每立方米水加漂白粉 6-10 g，將井封閉6 h后再用;飲水消毒藥物應選用效力強、毒性小、無殘留的消毒劑，可選用雙鏈季銨鹽類、二氯異氰尿酸鈉及碘酊等消毒劑，如可在牲畜的飲用水中添加 1:1000-2000 比例的碘福龍，做到安全有效消毒;
三是受到污染的畜禽飲水器、水槽、食槽等需通過清洗、消毒后方可再次使用，對于牛羊等放牧畜禽，要求放牧前要讓其充分飲水，以防放牧時因口渴而飲用污水導致生病，不要在洪水淹沒的草地上放牧牛羊。
4、加強種畜禽飼養管理。
做好母畜的保胎，肌肉注射黃體胴，對已流產的母畜，要增加營養，及時配種，同時加強仔畜禽的保育工作。要及時改良配種，因災延誤配種的畜禽，要抓緊補配。對有繁殖障礙的牲畜，要盡快治療。對已流產的母畜要增加營養，及時配種，并加強對仔、幼禽的保育工作。同時，水災后不宜立即補欄，要觀察了解本場及周圍畜禽養殖的健康狀況一切正常后，方可考慮引種補欄，引種應從證照齊全、生產管理水平較高和售后服務較好的種畜禽場引進，并要取得檢疫合格證等相關證件。
